熒光定量(liang)PCR(qPCR)實驗(yan)方(fang)法與操作指南(nan)如下(xia):
壹(yi)、實驗(yan)準(zhun)備
材料準(zhun)備:包括(kuo)PCR試(shi)劑盒(he)、模(mo)板DNA或(huo)RNA樣(yang)本、特(te)異性(xing)引物(wu)、熒(ying)光染(ran)料(如SYBRGreen)、DNA聚合(he)酶、緩沖液、dNTPs和(he)PCR管(guan)等(deng)。
二(er)、RNA提取與準(zhun)備
使用(yong)trizol法或其(qi)他常用(yong)RNA提(ti)取試劑盒(he),從(cong)組(zu)織(zhi)或細(xi)胞樣(yang)本中(zhong)提(ti)取RNA。確保在(zai)超(chao)凈工(gong)作臺(tai)上(shang)進(jin)行(xing),並避(bi)免RNA酶汙(wu)染(ran)。
對於(yu)RNA樣(yang)本,需(xu)通過(guo)反轉錄反應將(jiang)其(qi)轉化為(wei)cDNA,以便(bian)進行(xing)後(hou)續的qPCR實驗(yan)。
三(san)、引(yin)物(wu)與探針(zhen)設(she)計(ji)
根(gen)據目標(biao)序(xu)列(lie)設(she)計特異性(xing)引物(wu),確保引物(wu)具(ju)有(you)相近的Tm值(zhi),以保證同(tong)步(bu)擴增。
選(xuan)擇(ze)合(he)適的熒(ying)光染(ran)料或標(biao)記(ji)的探針(zhen),用(yong)於(yu)實時(shi)檢(jian)測PCR產物(wu)的生(sheng)成。
四(si)、PCR體(ti)系(xi)準(zhun)備
根(gen)據PCR試劑盒(he)的說(shuo)明(ming)書(shu),準(zhun)備包含(han)緩沖液、dNTPs、引物(wu)、熒(ying)光染(ran)料、聚合(he)酶和(he)水(shui)的PCR體(ti)系。
在(zai)無(wu)菌條(tiao)件下(xia)操(cao)作,避(bi)免汙(wu)染(ran)。
五(wu)、PCR反(fan)應(ying)
將PCR管(guan)放入PCR儀中(zhong),設(she)定合(he)適的PCR反(fan)應條件,包(bao)括(kuo)退火溫度、擴增周(zhou)期(qi)數等(deng)。
啟動PCR程序(xu),進行(xing)實時(shi)熒(ying)光定量(liang)PCR反應(ying)。
六(liu)、數(shu)據分(fen)析(xi)與結(jie)果解讀
利(li)用相關(guan)軟件對PCR儀生(sheng)成的熒(ying)光信號(hao)數(shu)據進行(xing)分(fen)析(xi),包括絕(jue)對定量(liang)法、相對定量(liang)法和(he)標(biao)準(zhun)曲(qu)線(xian)法等(deng)。
根(gen)據分(fen)析(xi)結(jie)果,計算樣本中(zhong)目(mu)標(biao)序(xu)列(lie)的濃度或表(biao)達水(shui)平。
以上(shang)即(ji)為(wei)熒(ying)光定量(liang)PCR實驗(yan)的基本方(fang)法與操作指南(nan)。在(zai)實驗(yan)中(zhong),應(ying)嚴格按照操(cao)作規程進行(xing),確保實驗(yan)的準(zhun)確性(xing)和(he)可重(zhong)復性(xing)。