熒(ying)光(guang)定量(liang)PCR實驗中(zhong)常見(jian)的(de)問(wen)題(ti)及其解決方(fang)案(an)對於確保(bao)實驗結(jie)果的(de)準確性和可靠性至關重要。以下是(shi)壹(yi)些(xie)常見(jian)問(wen)題(ti)及其相(xiang)應的(de)解決方(fang)案(an):
引(yin)物(wu)或(huo)探針降(jiang)解:引(yin)物(wu)和(he)探針的(de)降(jiang)解會影響(xiang)PCR擴(kuo)增(zeng)效(xiao)率和(he)特(te)異性。解決方(fang)案(an)是(shi)定期(qi)進行PAGE電(dian)泳檢測引(yin)物(wu)和(he)探針的(de)完整(zheng)性,避免使用(yong)降(jiang)解的(de)引(yin)物(wu)和(he)探針。
模(mo)板量(liang)不足(zu)或(huo)降(jiang)解:模板DNA或(huo)RNA的(de)量(liang)不足(zu)或(huo)降(jiang)解會導致PCR擴(kuo)增(zeng)失敗(bai)。解決方(fang)案(an)是(shi)確保(bao)模(mo)板的(de)純度(du)和完整(zheng)性,避免樣品(pin)制備(bei)過程中(zhong)的(de)雜(za)質引(yin)入(ru)和(he)反復凍融(rong)。對於未知(zhi)濃度(du)的(de)樣品(pin),應從系列稀釋(shi)樣本(ben)的(de)最(zui)高濃(nong)度(du)做(zuo)起。
反應循(xun)環數不夠:反應循(xun)環數不足會導致擴(kuo)增(zeng)不足,影響(xiang)結(jie)果的(de)準確性。解決方(fang)案(an)是(shi)增(zeng)加循(xun)環次數(shu),但需(xu)註(zhu)意(yi)避(bi)免過高的(de)循(xun)環數增(zeng)加背景信號(hao)。
反應條件(jian)不夠優(you)化:如退(tui)火溫度(du)、Mg2+濃度(du)、dNTPs濃度(du)等(deng)反應條件(jian)不合適(shi),會影響(xiang)PCR擴(kuo)增(zeng)效(xiao)率和(he)特(te)異性。解決方(fang)案(an)是(shi)根(gen)據引(yin)物(wu)的(de)Tm值(zhi)優(you)化退(tui)火溫度(du),調整(zheng)Mg2+和dNTPs濃(nong)度(du),以獲得(de)最(zui)佳的(de)擴(kuo)增(zeng)效(xiao)果。
加樣誤(wu)差:加樣不(bu)準確會導致標(biao)準品(pin)不(bu)呈(cheng)梯(ti)度(du),影響(xiang)定量(liang)結果的(de)準確性。解決方(fang)案(an)是(shi)確保(bao)加樣操(cao)作的(de)準確性,使用(yong)精確的(de)移液(ye)器,並(bing)避(bi)免交叉(cha)汙染。
儀(yi)器性能(neng)不穩定:PCR儀(yi)的(de)性能(neng)不穩定會影響(xiang)擴(kuo)增(zeng)效(xiao)率和(he)結(jie)果的(de)可靠(kao)性。解決方(fang)案(an)是(shi)定期(qi)對PCR儀進行校準和(he)維(wei)護(hu),確保(bao)儀(yi)器性能(neng)穩定。
綜上(shang)所述(shu),通(tong)過註(zhu)意(yi)引(yin)物(wu)和(he)探針的(de)完整(zheng)性、模板的(de)純度(du)和量(liang)、反應條件(jian)的(de)優化、加樣的(de)準確性以及儀器(qi)性能(neng)的(de)穩定性,可以大大(da)減少熒(ying)光(guang)定量(liang)PCR實驗中(zhong)的(de)問(wen)題(ti),提(ti)高實驗的(de)準確性和可靠性。